1.保障对象不同
职工医保面向的人群相对较窄，主要是企事业单位在职员工、退休职工以及灵活就业人员。
而城乡居民医保，保障的人群范围更广，包含下到幼儿上至老人所有年龄的人员，没有参加职工医保可以参加居民医保。不过也要注意：城乡居民医保只能在户籍地参加，而职工医保可以在工作地参加。
2.缴费的主体、方式不同
职工医保一般由单位和个人共同承担费用，按月缴纳，由单位负责办理。一般来说，缴费后的下个月即可享受医保待遇。灵活就业人员也可以用个人身份参保，但参保后需要等待一定期限，才可享受医保待遇。总体来看，绝大多数人是通过工作单位参加职工医保。
很多人可能因为换工作等原因导致医保中断，职工医保断缴超过一定时期（多为3个月），会暂停享受医保待遇，中断缴费的时期不计入医保累计缴费年限。如果继续缴费后，补齐医保中断期间的医保费，中断的时间则可以计入累计缴费年限。
居民医保由个人承担全部费用，一年一缴。居民个人每年的9-12月份，到当地社区或村委会办理下一年度的参保手续，就可以在下一年全年享受医保待遇，如果没有缴纳，则下一年不再享受医保待遇。
3.缴费金额不同
职工医保缴费的金额相对较高，由单位和个人，每月按一定的比例缴费。即便按最低基数缴费，每年缴费的总金额也至少几千元。城乡居民医保费用较低，一般在180-300元不等，远低于职工医保。
4.报销标准不同
职工医保的报销比例较高，通常在70%-90%。并且，退休时累计缴费达到国家规定年限（一般是，男性缴满25年，女性缴满20年，不同地区会有差异），退休后不用继续缴纳医保费，仍然可以享受职工医保报销待遇。未满国家规定年限的，需要缴费到规定年限。
城乡居民医保的报销比例多是在40%-80%，需要一直交，才能一直享受医保报销待遇。