ipo和新三板的准入条件不同、服务对象不同、交易规则不同、投资者群体不同。
一、准入条件不同
在准入条件上，ipo不设财务门槛，也没有主营业务要求。
但创业板不仅要求最近两年连续盈利，最近两年净利润累计不少于一千万元，且持续增长；或者最近一年盈利，且净利润不少于五百万无，最近一年营业收入不少于五千万无，最近两年营业收入增长率均不低于百分之三十，还要求主营业务突出，集中有限资源主要经营一种业务，并符合国家产业政策和环境保护政策。
二、服务对象不同。
全国股份转让系统的定位主要是为创新型、创业型、成长型中小微企业发展服务。这类企业普遍规模较小，尚未形成稳定的盈利模式。
三、交易规则不同。
新三板200人限制和投资者限制决定了较低的流动性。另外，新三板企业的股权高度集中，可流通股权比例低。
在交易方式上，新三板可以采取协议方式、做市方式、竞价方式或其他中国证监会批准的转让方式。而主板、创业板多采用竞价交易方式，大宗交易采用协议大宗交易和盘后定价大宗交易方式。
四、投资者群体不同。
我国证券交易所的投资者结构以中小投资者为主，而全国股份转让系统实行了较为严格的投资者适当性制度，对自然人和机构都有具体要求。未来的发展方向将是一个以机构投资者为主的市场，这类投资者普遍具有较强的风险识别与承受能力。