医疗保险具有强制性，是单位和职工共同缴纳的，并需要缴纳时间达到一定的年限。新型农村合作医疗是农民自愿参加，而且必须以家庭为单位整户参加。
1、投保对象
新农合是针对农村人口实行的医疗制度，医保是针对城市居民及企业职工（分为居民医保和职工医保两种）。
2、缴费标准
目前新农合的缴费标准一般是180每年，而居民医保一般是240每年，职工医保则跟个人工资以及当地平均工资挂钩。
3、报销比例
医保报销比例高于新农合报销比例，但目前多地已开始实行城镇居民医保和新农合统一的政策。
4、报销范围
医保报销范围比新农合广。