创业板公司退市后不再像主板一样，创业板对于退市公司是没有重新上市的安排，公司退市后必须进入代办股份转让系统。如符合代办股份转让系统条件，退市公司可自行委托主办券商向中国证券业协会提出在代办股份转让系统进行股份转让的申请。
退市标准一旦付诸实施，对投资者影响巨大。由于公司退市的市场风险投资者必须自行承担，因此，投资者在参与创业板投资时，应当重点关注上市公司的技术风险和经营风险。
一般而言，将高科技转化为现实的产品具有较高的不确定性，将受到多种可变因素以及事先难以估测的不确定性因素影响，存在出现技术失败而造成损失的技术风险。
此外，处于成长型的创业期企业，盈利模式、市场开拓都处于初级阶段，经营稳定性整体上低于主板上市公司，一些上市公司经营可能大起大落甚至经营失败，因此退市风险较大。
一旦上市公司出现财务或者其他状况异常，导致其股票存在终止上市风险，深交所将会对该公司股票交易实行风险警示处理。