新农合省内跨市就医报销流程为：
1.参合人或其家人携带好参合人身份证或户口本、新农合医疗证等证件前往参合地办理备案，或者也可以拨打当地新农合经办机构热线备案；
2.参合人携带好身份证、新农合医疗证和转诊备案手续证明前往转诊医院就医，注意必须是在新农合定点医疗机构就医；
3.住院治疗结束，参合人凭借本人身份证或户口本、新农合医疗证、病历、住院结算清单或发票、住院费用清单、转诊备案证明等到新农合经办机构报销结算即可。
跨省就医新农合报销流程具体如下：
1.先到参保地的经办机构办理转诊备案手续；
2.在医院就医，办理新农合住院手续；
3.再住院接受治疗；
4.携带医疗缴费单据、医保卡等材料去定点的医疗机构，或者社保经办机构结算相关费用。 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准，按照国家规定执行。
新农合是居民医保，跨省就医是异地医保，如何报销要看当地是否与国家医保联网。现在绝大部分地区都已经开通了异地就医联网。
如果你的参保地联了网，你就不必跑到当地的医保中心备案了，你在手机上下载国家医保服务平台网站，找到异地就医备案一栏，按提示输入你的医保信息，选择异地就医省份和城市及时间，待通过后就可以持自己的医保卡到异地的医保定点医院就诊看病了，享受参保地的报销政策，直接按比例报销，不用再回当地报销了。
1）转诊情况下，可直接在就诊的医院结算，无需再回当地报销。
如果出院时未结算，就需要带着住院小结、住院票据、身份证复印件、医保卡复印件、转诊证明等回当地乡镇的卫生院报销。
（2）未办理转诊，但是有新农合情况，就必须回当地办理报销了。带着住院小结、住院票据、身份证复印件、医保卡复印件等到当地乡镇的卫生院报销即可。