分两种情况，非食品类和食品类企业标准备案
一、非食品类企业标准备案
1. 网上查阅生产或销售的产品是否具有适用的且现行的国家标准、行业标准或企业所在省的地方标准
a）如果有，那么可以将国家标准、行业标准或企业所在省的地方标准作为执行标准
b）虽然有，但是认为适用的标准管控指标太宽松，可以制定严于现行标准的企业标准
c）虽然有，但是认为适用的标准管控的指标还不够，可以制定对现行标准进行补充完善的企业标准
d）如果没有，需要制定企业标准作为执行标准。
2. 企业标准文本编写
3. 企业标准审核（可以内部组织专家审核，也可以委外组织专家审核）
4. 企业标准网上自我公开备案
5. 企业标准公开后即视为备案完成
二、食品类企业标准备案
1. 食品企业标准备案必须至少有一个指标严于食品安全国家标准或食品安全地方标准
2. 食品企业标准文本编写
3. 准备网上公示资料（一般需要加盖公章）
4. 组织专家审核（仅部分省要求）
5. 网上公示（各省公示时间不定，5-20个工作日不等）
6. 公示结束后提交正式备案资料（一般需要加盖公章）
7. 卫健委食品企业标准审核部门审核企业备案资料
8. 审核通过后即发放企业标准备案成功的资料
申请产品企业标准备案号的主要流程如下：
1、先根据产品，查查有无国家标准、行业标准、地方标准。
2、查出结果若有列之一情况的，需要编制产品的企业标准：
——该产品没有国家标准、行业标准、地方标准的；
——该产品不属于国家标准、行业标准、地方标准规定的适用范围的；
——该产品高（或严格）于国家标准、行业标准、地方标准，但企业有制定企业标准要求的；
3、编制产品的企业标准（初稿）。
4、送检产品。
5、根据产品检验报告和其它情况，组织人员对企业标准（初稿）进行修改形成企业标准送审稿。
6、组织专家对企业标准送审稿进行审查，并做好会议记要和审查结论。
7、整理好将上述过程中形成的相关材料后，向企业标准主管部门申报备案。
8、按主管部门备案要求补充相关的资料，并按主管部门提出意见进行修改完善即可。
对有些产品或某些行业（地方）对上述流程可能有不同的改变，但其本质上没有多大的差别