蛋白质组学产生于20世纪90年代，是以生物体的全部或部分蛋白为研究对象，研究一个生物、一个细胞(组织)或基因组的蛋白质的变化规律的一门学科。
蛋白质组学能够在整体水平上研究蛋白质的表达、调控的水平和规律，目的是了解蛋白质间的联系与相互作用，为生命活动规律提供理论和物质基础，为人类的健康带来理论依据和解决方案。
由于平台规定发不了链接，数据库地址详见文末。
1.UniProt(The Universal Protein Resource)
简介：提供详细的蛋白质序列、功能信息，如蛋白质功能描述、结构域结构、转录后修饰等，同时提供其他数据库，包括序列数据库、三维结构数据库、2-D凝聚电泳数据库、蛋白质家族数据库的相应链接
2.PIR(Protein Information Resource)
简介：与90多个生物数据库(蛋白家族、蛋白质功能、蛋白质网络、蛋白质互作、基因组等数据库)存在着交叉应用，可提供及时的、高质量、最广泛的注释
3.BRENDA(Enzyme database)
简介：酶数据库，提供酶的分类、命名法、生化反应、专一性、结构、细胞定位、提取方法、文献、应用与改造及相关疾病的数据
4.CORUM(Collection of experimentally verified mammalian protein complexes)
简介：哺乳动物蛋白复合物数据库，提供的数据包括蛋白复合物名称、亚基、功能、相关文献等
5.CyBase(Cyclic protein database)
简介：环状蛋白数据库，提供环状蛋白的序列、结构等数据，提供环化蛋白预测服务
6.OKCAM
简介：人体细胞粘附分子数据库
7.GELBANK
简介：提供全基因组的二维凝胶电泳图谱，搜集了已知基因组信息生物的蛋白质组二维凝胶电泳图。可通过描述相对分子质量、等电点和蛋白质序列信息进行快速检索
8.SWISS-2DPAGE
简介：提供人类、小鼠、大肠杆菌、酿酒酵母、盘基网柄菌的2D-PAGE参考图
9.SysPIMP(Systematical Platform for Identifying Mutated Proteins)
简介：通过质谱技术建立的蛋白质突变数据库
10.Sys-BodyFluid
简介：人体体液蛋白组研究数据库
11.DB-PABP
简介：聚阴离子结合蛋白数据库
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