财政全供和财政差供的单位在单位性质、单位工资发放方式、单位员工的收入、单位的职能权限皆有区别。财政全供的单位在财政上由国家政府完全拨款，承担所有的员工工资以及单位财务支出。财政差供的单位在财政上国家政府只承担部分支出，其余部分由单位自身收入补足。
财政全供和财政差供的完整区别
1、单位性质不同：财政全供的单位主要是执行国家公务的行政机关单位和公益一类事业单位。财政差供的单位主要是公益二类事业单位；
2、工资发放方式不同：财政全供的单位员工工资和福利待遇全由政府负担，财政差供的单位只负责员工工资和公用支出的一部分，其余部分由单位自身收入承担；
3、收入不同：财政全供的单位员工完全由政府供养，因此员工工资有保障。财政差供的单位，政府只负担部分工资，如果单位收入不佳，员工工资会下滑，因此两个单位员工之间的收入有所区别；
4、职能权限不同：财政全供的单位财政支出只能由政府提供，财政差供的单位除了政府的拨款，还能由该单位自身产生收入。拥有执法权和收费权的财政差供单位，还能通过财政返还制度获得更多的收入。