留痕简单来讲就是恐龙婴儿时期头顶上的3个不同任务，主要有要抱抱、想走走和恐龙饲料3种，按恐龙宝宝要求的任务完成后，即可进行一次留痕，增加对应百分比的属性，每只恐龙每次留痕任务所能增加的留痕值也不同。
第一是随机吃一种饲料，饲料种类由地图决定，飞龙会要求飞龙奶和岩龙会要求无名怪毒液。把恐龙要求的饲料或者毒奶放到快捷栏的0号位，靠近恐龙按E喂食。
第二是想要主人抱一抱，只需要对恐龙按E抱一抱即可。
第三是想要散步，对恐龙吹跟随并走大约0–20个地基的距离。如果恐龙是在袋鼠的育儿袋中，移动袋鼠也算。
目前版本每八小时留一次痕，并且上一轮留痕没有完成下一轮不会开始。每次留痕的留痕进度由恐龙的成长时间决定，一般来说每次留痕进度=恐龙总成长时间÷8。每次留痕进度显示值是实际值的四舍五入，因为游戏中不能显示小数，所以可能第一次留痕加33%，第二次就67%了。