1、概念不同；
2、算法不同；
3、算量不同；
4、对经济增长产生的效应不同。
以上四点就是绿色GDP与普通GDP之间的差异。绿色GDP是基于原始GDP的重新计算，补偿了由污染，毒害和高能耗引起的损失。绿色GDP基于原始GDP，同时考虑了环境和资源成本，因此环境成本和资源成本的计算成为可持续收益计算的关键。
绿色GDP与原有GDP的具体差异
1、概念上的不同： GDP国内生产总值是指一个国家或地区的所有居民单位在一定时期内生产的所有最终产品和服务的市场价值。绿色GDP是指从GDP中减去自然资源损耗价值和环境污染损失后的价值剩余的GDP；
2、算法的不同：从算法上讲，GDP有两种计算方法，也就是收入法和支出法。收入法是从收入的角度来计算，通过将生产中来自生产要素的各种收入相加来计算；支出法计算国内生产总值的方法则是从产品的使用出发，将一年中购买的各种产品最终的支出相加，以计算当年生产的最终产品的市场价值，在支出法下，GDP为一个国家或地区在一定时期内居民消费、企业投资、政府购买和净出口这几方面支出的总和。绿色GDP是以总GDP的计算为基础，减去中间消耗性质的自然资源消耗成本；
3、算量的不同：由于算法不同，绿色GDP和GDP的计算量也不同。因为绿色GDP必须在计算总GDP的基础上减去中间的自然资源消耗成本，所以绿色GDP的值通常小于GDP的值；
4、对经济增长产生的效应不同：由于部分GDP是从资源和生态环境的“透支”中获得的，因此不能反映国民经济增长的净正负效应；而绿色GDP指标则代表了国民经济增长的净正负效应，绿色GDP在GDP中所占的比例越高，国民经济增长的正面效应就越高，国民经济增长对自然的消极影响则越低，经济增长与自然环境之间的协调性就越高。