1、性质：商行严格意义上属于个体户，公司则属于企业；
2、注册资本：公司的注册资本最低为3万，商行不需要注册资本；
3、税务缴纳：公司的税务缴纳范围比较广，而商行基本只需要交营业税的最低税；
4、对风险的承担：公司的企业法人承担有限责任，商行负责人承担无限责任。
创业注册公司好还是商行好
创业注册公司较好，原因如下：
1、合法性：公司的业务办理上比较容易，商行的注册虽然简单也不需要注册资金，但难以获得投资，许多补贴政策也都倾向于公司而不是商行；
2、发展性：公司更适合制定长远的规划，存活与扩张的可能性更大，项目的选择上也比较清晰；
3、团队性：与商行相比，公司有明确的组成结构与分工，有团队，更适合整体向前发展；
4、灵活性：若从事的行业不适合，公司比商行更容易改变方向。