在《自然·遗传学》发表的一项新研究中，来自美国农业部农业研究局和博伊斯·汤普森研究所等机构的研究人员绘制了人工栽培和野生西红柿的基因组图谱。该团队标记了近 5000 个以前未知的基因，将人工栽培西红柿的基因组与野生西红柿的基因组进行比较，并获得了不少有趣的发现。
2012 年科学家首次对普通栽培西红柿进行了基因组测序，该次测序的西红柿品种为 Heinz 1706。这项新工作将这种观点扩展到所有定期种植的番茄品种及其“近亲”的完整基因组。这包括来自 725 种不同品种西红柿的所有基因，并且在此过程中，该团队发现了额外的 4873 个基因，这些基因未包括在 Heinz 1706 基因组中。
在将人工栽培的西红柿与其野生对应物进行比较时，研究人员注意到我们通常在超市中购买的西红柿丢失了数千种基因。在追求能够以更快的速度获得更大更多西红柿的过程中，种植者似乎放弃了味道等特性。
“构建这种泛基因组最重要的发现之一是标记为 TomLoxC 的罕见基因形式，其 DNA 基因启动子的版本大多不同，”该论文的共同作者 James Giovannoni 在一份声明中说道。“该基因通过催化许多脂质-挥发物的生物合成来影响水果的味道 – 这些化合物容易消失。”
根据他们自己的测试，研究人员认为，这种与味道有关的基因仅存在于2% 的人工栽培西红柿中，但在超过 90％ 的野生西红柿中发现。
Giovannoni 说道：“在西红柿的早期栽培品种中，似乎存在强烈的选择压力，或者至少没有选择这种版本的 TomLoxC。这种形式在现代西红柿中流行的增加可能反映了育种者对改善味道的新兴趣。”
研究人员表示，获取有关如此多西红柿品种基因组的详细数据将有助于育种者栽培更美味的作物，这些作物仍保留基因，使其能够远距离运送到超市。