灵活就业者与企业职工不同，灵活就业者没有固定的工资收入其收入会经常性的发生变动，收入的变动也使灵活就业者的养老保险缴纳费用上与企业职工有所不同。
一：缴费限制不同。企业会为企业职工缴纳五险一金，国家强制性要求用人单位和劳动者必须参加社保。而灵活就业者是以个人名义缴纳社保，灵活就业者的失业、工伤和生育保险是不需要纳入缴纳范围，只需要缴纳养老保险和医疗保险即可。
二：承担费用不同。以灵活就业者身份缴纳社保的费用要比职工缴纳社保承担的比重要大一些。企业职工在缴纳养老保险是由单位和个人共同承担，个人需要缴纳8％的比例其余的20％由单位承担，而灵活就业者就需要自己全部承担20％的比例。
三：享受的待遇不同。企业员工一般男性年满60周岁，女性工人年满50周岁，女性干部年满55周岁就可以提出退休申请；如果从事危害身体健康的工作，男性达到55周岁，女性达到45周岁就可以因此退休；如果因病或者其他原因造成的残疾有医院提供证明经过劳动监委会鉴定完全丧失劳动能力的，男性员工可以在50周岁提出退休，女性员工可以在45周岁提出退休。而灵活就业者要根据法律的规定，男性达到60周岁，女性达到55周岁才可以提出退休。
四：险种的待遇不同。企业职工除了医疗保险和养老保险以外还有其他失业险、生育险和工伤三种待遇。而自由职业者只有养老保险和医疗保险。
在退休后退休上一年度的当地平均工资、累计缴费年限的长短以及缴费基数的高低等都会影响养老金领取。当然缴费基数越高，累计缴费年限越长领取的养老金越多，这与以灵活就业者身份缴费或者企业缴费的缴费方式是没有任何影响的。
虽然在一些方面灵活就业者身份缴纳的社保与职工养老保险都是有一定差别的，但是总体来说待遇都是很不错的，我国对于养老保险方面的规定还是很人性化的考虑都是比较周全的。