微信健康码和支付宝健康码是一样的，从定位上来说支付宝的健康码是国家一级的，因为支付宝在国务院办公厅电子政务办指导下建立全国统一的疫情防控健康码系统。而微信主要是与国家信息中心联合推出“健康码”的标准，并非建立全国统一的健康码系统，所以相比较而言支付宝定位更高。
但是两者效用是一样的，可以通过支付宝也可以通过微信申领自己的健康码。但腾讯今后又在国家信息中心指导下联合各方推出不限于疫情防控的公益性建设工程：“数据长城”计划，持续助力国家现代化建设。
支付宝率先在浙江杭州推出了健康码，上线第一天就达到了1000万，而后迅速推广到浙江其他省市。其主要是有“绿码、黄码、红码”三色动态管理，实施隔离14天的是红码、实施7天隔离的是黄码、如果连续打卡都是正常的，则自动转为绿码表示健康可以凭借这个二维码通行。这一模式很快引起国家注意，于是在国务院办公厅电子政务办的指导下，支付宝正在建立基于全国一体化政务平台的全国统一疫情防控健康码系统。
浙江杭州开始实行健康码后，腾讯和深圳也同时快速推出全面实施健康码。人员可以通过微信小程序“深i您”、公众号“i深圳”等平台个人申报后可以取得.健康码，实现二维码通行。并且广东等其他地方也迅速加入健康码模式实施。另外腾讯并且和国家信息中心联合推出“健康码标准’推荐给各地作为技术标准规范在全国推行尽快实施。